Quatre gènes identifiés

JESSICA ZUCMAN-ROSSI (INSERM U674, université Paris-Descartes) et son équipe décrivent quatre gènes non encore identifiés dans des cancers du foie.

Les chercheurs se sont appuyés sur de nouvelles techniques de séquençage du génome (séquençage à haut débit). Ils montrent que le code génétique de personnes atteintes d’un cancer du foie présente souvent des modifications spécifiques et significatives : les bases G sont remplacées par des bases T. Des observations qui font dire aux chercheurs : « cela suggère fortement, en dehors d’une cirrhose du foie préexistante, l’implication d’un agent toxique qui entraînerait des mutations dans l’ADN de ces patients ». Dans les zones tropicales, l’aflatoxine B1 est un mutagène du foie déjà connu. Les agents toxiques atteignant des patients vivant en France restent à identifier.

L’analyse par séquençage à haut débit de l’ensemble des mutations a révélé les quatre nouveaux gènes (ARID1A, RPS6KA3, IRF2 et NFE2L2). Ils ont été testés sur des échantillons de 125 tumeurs hépatiques. Ce qui montre l’altération de plusieurs voies de signalisation selon les gènes : la voie VNT Caténine, celle de P 53, ou l’activation des voies du stress oxydatif, de l’interféron et de la signalisation RAS.

Enfin, chez les patients ayant une intoxication alcoolique chronique, les gènes de stabilisation de l’ADN sont fréquemment altérés.

Depuis 2009, la France mène ce grand essai pilote sur le cancer du foie, dans le cadre du projet International Cancer Genome Consortium (ICGC). L’objectif est de séquencer le génome de tumeurs d’un grand nombre de patients, pour identifier le rôle d’altérations génétiques dans le développement d’une cinquantaine de tumeurs différentes. Coordonnée par l’INCa et l’INSERM, la participation française à l’ICGC porte sur quatre programmes concernant un type de cancer du sein, les cancers agressifs de la prostate, le sarcome d’Ewing et le cancer du foie.

En 2009 avait démarré une étude pilote en France pour réaliser une première série de 24 séquençages de carcinomes hépatocellulaires, menée par Jessica Zucman-Rossi. Ce sont ces premiers résultats qui sont publiés.